5天缩至5小时 英伟达GPU加速DNA定序

    全新的 “EasyGenomics ”服务由位于中国深圳的华大基因提供，该项服务将直观的用户界面与华大基因自动化的流水线分析、软件以及工具相结合。它们与业内最大的定序平台集成在一起，为生物学家、生物信息学家以及最终为内科医生提供所需的全部内容，使其能够提交和收到DNA定序数据的自动化分析。

    英伟达GPU可加速处理大型DNA数据分析，与使用基于CPU的系统相比，能够令处理时间从数日缩短至区区数小时。EasyGenomics由英伟达GPU加速，因而为全球研究人员大大扩展了高级基因组研究功能的可用性，让科学离低价可行的个性化药品时代更近一步。

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    针对2012年Bio-IT World展会上符合资格要求的生物学家和生物信息学家，华大基因现在正在推出这项全新服务的有限免费试用。如需了解更多信息或如需申请免费试用，敬请访问EasyGenomics网站。

    华大基因副总裁方林 (音译) 博士表示：“通过让更多研究人员以更低的价格更轻松地加速DNA定序数据，我们希望能够便于医生在临床诊断以及复杂的疾病研究中把运用基因组作为医疗工作的一个可行的组成部分。GPU加速让科学家能够比以往更快地分析DNA定序数据，将所用的时间从五天缩短至短短五个小时。在云端充分完成部署之后，我们预计EasyGenomics将在基因组研究领域中掀起革命。”

    EasyGenomics 云服务采用基于英伟达Tesla M2070和M2075 GPU的混合型计算系统，这些GPU连同系统CPU一起为DNA定序数据分析加速。当EasyGenomics服务充分完成部署时，华大基因计划新增数以百计的英伟达Tesla GPU来对其进行升级，届时预计该服务将支持数以千计的用户。

    英伟达公司Tesla事业部高级总监Sumit Gupta表示：“由于定序成本的下降，今年或将成为1000美元基因组之年。我们很快将淹没在基因组定序的海量数据当中。华大基因的EasyGenomics服务利用GPU计算的处理能力来为科学家提供一条低价且简单易用的途径，使其能够轻松解决这种全新的大型基因数据问题，让我们能够离有效而低价的个性化医疗更近一步。”

    从植物与大肠杆菌到大熊猫，在对各种生命形式进行基因组定序这方面，华大基因从事着开创性的工作，目的是开发出更好的药物、改善医疗以及开发出基因更优秀的食物。华大基因总部位于中国深圳，在美国马萨诸塞州坎布里奇和丹麦哥本哈根设有分支机构，其目标是让最前沿的基因组科学得到普及。

原文出处：http://nb.zol.com.cn/291/2916671.html

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